黃巖島事件過(guò)去半年之后，2013年1月22日，菲律賓阿基諾三世政府以中國(guó)主張并行使在南海九段線內(nèi)的主權(quán)和或主權(quán)權(quán)利和管轄權(quán)為由，根據(jù)《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》，擬定了15項(xiàng)訴求，向國(guó)際法庭提請(qǐng)仲裁。

2013年2月19日，中國(guó)政府退回菲律賓政府的照會(huì)及所附仲裁通知。中國(guó)政府鄭重聲明，中國(guó)不接受、不參與菲律賓提起的仲裁。

（中國(guó)2008年根據(jù)《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》第298條的規(guī)定向聯(lián)合國(guó)秘書長(zhǎng)提交聲明。該聲明稱，關(guān)于《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》第298條第1款（a）、（b）和（c）項(xiàng)所述的任何爭(zhēng)端，即涉及海域劃界、歷史性海灣或所有權(quán)、軍事和執(zhí)法活動(dòng)以及安理會(huì)執(zhí)行《聯(lián)合國(guó)憲章》所賦予的職務(wù)等爭(zhēng)端。中華人民共和國(guó)政府不接受《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》第十五部分第二節(jié)規(guī)定的任何程序。也就是說(shuō)，中國(guó)將涉及海洋劃界、歷史所有權(quán)、軍事行動(dòng)、行政執(zhí)法等問(wèn)題排除適用強(qiáng)制爭(zhēng)端解決程序。

而南海仲裁案的實(shí)質(zhì)就是領(lǐng)土主權(quán)和海洋劃界問(wèn)題。領(lǐng)土主權(quán)問(wèn)題不是《公約》的調(diào)整范圍，而涉及海洋劃界問(wèn)題，中國(guó)已作出了排除性聲明。因此，中國(guó)不接受、不參與仲裁完全符合包括《公約》在內(nèi)的國(guó)際法?！豆s》第280、281、282條也規(guī)定，尊重《公約》締約國(guó)自主選擇爭(zhēng)端解決方式的權(quán)利。中菲兩國(guó)已經(jīng)達(dá)成通過(guò)談判協(xié)商解決有關(guān)爭(zhēng)議的共識(shí)，已排除將《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》規(guī)定的強(qiáng)制爭(zhēng)端解決程序適用于中菲南海有關(guān)爭(zhēng)議。這個(gè)權(quán)利也應(yīng)予以尊重。中方堅(jiān)持不接受，不參與，不承認(rèn)菲律賓提起的仲裁。）

2013年5月，國(guó)際海洋法法庭時(shí)任庭長(zhǎng)柳井俊二接受了菲律賓強(qiáng)行提出的仲裁案，并由五名專業(yè)人士組成的仲裁庭。菲律賓方面指派國(guó)際海洋法法庭現(xiàn)任法官、德國(guó)人呂迪格·沃爾夫魯姆在仲裁庭中代表菲律賓。由于中方不參與仲裁，因此剩余4人均由柳井俊二指派。

2013年7月，臨時(shí)仲裁庭成立的第二個(gè)月，它以人力和資源有限為由，把秘書服務(wù)正式“外包”給常設(shè)仲裁法院，具體服務(wù)內(nèi)容包括協(xié)助查找和指定專家，發(fā)布信息和新聞稿，組織在海牙和平宮舉行聽(tīng)證會(huì)，支付仲裁員和其他人員的費(fèi)用等，也就是選定常設(shè)仲裁法院作為案件的書記處。

2014年12月7日，中國(guó)外交部受權(quán)發(fā)布了《中華人民共和國(guó)政府關(guān)于菲律賓共和國(guó)所提南海仲裁案管轄權(quán)問(wèn)題的立場(chǎng)文件》，全面系統(tǒng)闡明了中國(guó)政府對(duì)該仲裁案管轄權(quán)問(wèn)題的立場(chǎng)，即仲裁庭對(duì)菲律賓單方面提起的南海仲裁案沒(méi)有管轄權(quán)，中國(guó)政府不接受、不參與菲律賓提起的仲裁擁有充分的國(guó)際法依據(jù)。

2015年4月，中國(guó)外交部長(zhǎng)王毅先后赴俄羅斯出席中俄印外長(zhǎng)第十四次會(huì)晤、訪問(wèn)東盟三國(guó)、參加亞信外長(zhǎng)會(huì)議，俄羅斯、印度、文萊、柬埔寨、老撾、岡比亞、波蘭、巴基斯坦、孟加拉國(guó)、白俄羅斯、吉爾吉斯斯坦等11國(guó)相繼表態(tài)支持中國(guó)南海立場(chǎng)。

2015年5月12日，在多哈舉行的中阿合作論壇第七屆部長(zhǎng)級(jí)會(huì)議通過(guò)《多哈宣言》?！缎浴窂?qiáng)調(diào)，阿拉伯國(guó)家支持中國(guó)同相關(guān)國(guó)家根據(jù)雙邊協(xié)議和地區(qū)有關(guān)共識(shí)，通過(guò)友好磋商和談判，和平解決領(lǐng)土和海洋爭(zhēng)議問(wèn)題；強(qiáng)調(diào)應(yīng)尊重主權(quán)國(guó)家及《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》締約國(guó)享有的自主選擇爭(zhēng)端解決方式的權(quán)利。

2015年5月25日，上合組織會(huì)議上，各國(guó)外長(zhǎng)一致確認(rèn)，所有有關(guān)爭(zhēng)議均應(yīng)由當(dāng)事方通過(guò)友好談判和協(xié)商和平解決，反對(duì)國(guó)際化和外部勢(shì)力干涉。為此，外長(zhǎng)們呼吁恪守上述公約、《南海各方行為宣言》及落實(shí)宣言后續(xù)行動(dòng)指針全部條款。

2015年7月7日，法院首次舉辦了南海仲裁案聽(tīng)證會(huì)。中華人民共和國(guó)外交部同時(shí)發(fā)表聲明，不承認(rèn)常設(shè)仲裁法院對(duì)此案的司法管轄權(quán)，也拒絕接受菲律賓任何形式有關(guān)此案的和解建議。

2015年10月29日，仲裁庭作出管轄權(quán)和可受理性問(wèn)題裁決。中國(guó)政府當(dāng)即聲明有關(guān)裁決是無(wú)效的，沒(méi)有拘束力。

2016年6月8日，中國(guó)外交部發(fā)布了《中華人民共和國(guó)外交部關(guān)于堅(jiān)持通過(guò)雙邊談判解決中國(guó)和菲律賓在南海有關(guān)爭(zhēng)議的聲明》，重申中國(guó)堅(jiān)持不接受、不參與菲律賓仲裁案以及通過(guò)雙邊談判解決中菲在南海有關(guān)爭(zhēng)議的立場(chǎng)。

2016年7月12日，菲律賓南海仲裁案仲裁庭作出非法無(wú)效的所謂最終裁決，判菲律賓“勝訴”，并否定了“九段線”，還宣稱中國(guó)對(duì)南海海域沒(méi)有“歷史性所有權(quán)”。

同日，新華社發(fā)表報(bào)道，從中共中央對(duì)外聯(lián)絡(luò)部獲悉，當(dāng)前已有90多個(gè)國(guó)家的230多個(gè)政黨和政治組織表示公開(kāi)支持中國(guó)在南海問(wèn)題上的立場(chǎng)。

2016年7月13日上午，新華社海牙分社記者向國(guó)際法院提問(wèn)：“南海仲裁案裁決結(jié)果公布后，很多西方媒體報(bào)道說(shuō)聯(lián)合國(guó)支持的法庭甚至聯(lián)合國(guó)法庭對(duì)南海案做出裁決。國(guó)際法院可否置評(píng)？”當(dāng)天下午，國(guó)際法院在其官網(wǎng)刊出中英文聲明：“南海仲裁案裁決結(jié)果由常設(shè)仲裁法院提供秘書服務(wù)的一個(gè)仲裁庭做出。國(guó)際法院作為完全不同的另一機(jī)構(gòu)，自始至終未曾參與該案，因此在國(guó)際法院網(wǎng)站上無(wú)法查詢到相關(guān)信息。”

同日，聯(lián)合國(guó)表態(tài)和南海仲裁庭沒(méi)有任何關(guān)系，稱國(guó)際法院是聯(lián)合國(guó)主要司法機(jī)關(guān)，根據(jù)《聯(lián)合國(guó)憲章》設(shè)立，位于荷蘭海牙的和平宮內(nèi)。這座建筑由非營(yíng)利機(jī)構(gòu)卡內(nèi)基基金會(huì)為國(guó)際法院的前身常設(shè)國(guó)際法院建造。聯(lián)合國(guó)因使用該建筑每年要向卡內(nèi)基基金會(huì)捐款。和平宮另一“租客”是1899年建立的常設(shè)仲裁法院，不過(guò)和聯(lián)合國(guó)沒(méi)有任何關(guān)系。

2016年7月14日，聯(lián)合國(guó)秘書長(zhǎng)發(fā)言人迪亞里克在例行記者會(huì)上表示，仲裁庭的運(yùn)作與聯(lián)合國(guó)秘書長(zhǎng)沒(méi)有關(guān)系。

同日，國(guó)際法院新聞部負(fù)責(zé)人安德烈·波斯卡庫(kù)金向新華社記者重申，一些媒體對(duì)南海仲裁案仲裁庭確實(shí)存在誤解，“事實(shí)上，國(guó)際法院與南海仲裁案沒(méi)有絲毫關(guān)系”。

國(guó)際海洋法法庭也出面發(fā)聲。國(guó)際海洋法法庭新聞發(fā)言人朱莉婭·里特爾向新華社駐柏林記者澄清：“臨時(shí)仲裁庭不從屬于國(guó)際海洋法法庭?！彼f(shuō)，國(guó)際海洋法法庭與《聯(lián)合國(guó)海洋法公約》第287條第1款提及的所有法院、仲裁庭都不存在上下級(jí)從屬關(guān)系，因此不會(huì)對(duì)“其他法院或法庭”作出的裁決發(fā)表評(píng)論。

7月15日，菲律賓前總統(tǒng)阿羅約的新聞發(fā)言人和辦公廳主任戈韋托·蒂格勞在《馬尼拉時(shí)報(bào)》發(fā)表評(píng)論文章稱，菲律賓僅用于支付南海仲裁案的律師費(fèi)就高達(dá)3000萬(wàn)美元。菲律賓前參議員弗朗西斯科·塔塔德隨即公開(kāi)追問(wèn)，按照菲律賓憲法，政府的財(cái)政撥款須有記錄或公示，但上述巨款來(lái)源和用途均無(wú)任何記錄。因此，他質(zhì)疑阿基諾三世政府對(duì)民眾隱瞞了南海仲裁案真相，南海仲裁案資金來(lái)路不明。

7月25日，中國(guó)外交部長(zhǎng)王毅在老撾萬(wàn)象出席東亞合作系列外長(zhǎng)會(huì)期間會(huì)見(jiàn)美國(guó)國(guó)務(wù)卿克里?？死餁g迎中國(guó)和東盟發(fā)表有關(guān)聯(lián)合聲明，表示美方對(duì)南海仲裁結(jié)果不持立場(chǎng)，支援中菲恢復(fù)雙邊對(duì)話，應(yīng)盡快翻過(guò)仲裁案這一頁(yè)，使南海局勢(shì)降溫。